A Universidade de Évora está organizada em 4 escolas: Artes, Ciências e Tecnologia, Ciências Sociais e Enfermagem e oferece 41 cursos de graduação e 85 de pós-graduação. Investigação e Desenvolvimento (I&D) abrange diversas áreas científicas por meio de uma rede de 17 unidades de investigação, todas submetidas a avaliação internacional, sob a coordenação do Instituto de Pesquisa e Estudos Avançados. Além disso, a Universidade de Évora estabeleceu três Cátedras em áreas de excelência: Biodiversidade, Energias Renováveis e Patrimônio, que são financiadas por investimento privado. As principais áreas de I&D são: Agronomia e Biodiversidade; Geofísica, Meio Ambiente e Paisagem; Ciências dos Materiais; Economia e Gestão; Ciências da Computação e Interoperabilidade de sistemas; Ciências Políticas e Sociais, História, História da Arte, Ciência e Cultura; Matemática Aplicada; Ciências da Educação; Literatura; Saúde. Os 150 projetos de I&D em andamento são desenvolvidos por meio de parcerias nacionais e internacionais, financiado por FP7 e H2020, FCT e também por investimento privado.